清洁能源研究所现有教师19人，其中教授8人，副教授6人，讲师3人、研究员2人；博士生导师12人，硕士生导师17人。研究所围绕可再生能源在建筑中的应用、区域能源与生态环境规划、清洁能源开发与利用、储能装备与储能系统与技术、特殊空间与设备热管理、氢能技术、生物质能利用、燃气高效低污染利用、甲烷排放检测与量化评估、城镇燃气生命线安全、建筑环境安全与保障、特殊建筑能源供应与环控系统、建筑环境能效评测等研究方向形成了鲜明的研究特色。研究所有国家级专业学会委员、理事4名，中国土木工程学会燃气分会副理事长1名，住建部专业评估委员会以及标准委员会委员各1名，中国城市燃气协会高校工作委员会主任、秘书长各1名，国际制冷学会空调委员会委员1名，重庆市制冷学会理事长、副理事长各1名，重庆市土木建筑学会热能动力专业委员会主任委员、副主任委员各1名。研究所近3年来承担国家级、省部级以及横向科研课题、教改课题130余项，科研经费超过3000万元，发表国际期刊SCI收录论文120余篇。研究所主编包括国家级等各类教材6部，出版专著5部，获得省部级奖4项、行业奖10余项，主编、参编、参与审查国家、行业、地方标准30余项。目前研究所在校硕士、博士研究生近200名，研究生获得国家与行业科研与设计奖项30余项。

研究所已与美国、澳大利亚、新加坡、丹麦、日本等10多所国外知名大学和研究机构建立了长期的合作研究关系。研究所承担了大量国内重大工程清洁能源系统的规划、设计、咨询、测试等科研工作，在国内工程清洁能源系统技术示范、地方建设与工程设计咨询等方面发挥了重要的作用。